El 4 de julio de 1844, Santiago y el Ejército del Norte proclamaron a Juan Pablo Duarte presidente de la República, condicionado a preservar la soberanía nacional, convocar la Constituyente y enfrentar la crisis fiscal. El movimiento no consiguió imponerse sobre el poder militar de Pedro Santana, pero reveló la primera gran disputa sobre la organización del Estado dominicano.
El 30 de marzo de 1844, Santiago defendió la recién proclamada República frente al ejército de Jean-Louis Pierrot. La victoria fue obtenida mediante la movilización del Cibao, el aprovechamiento del terreno y el fuego coordinado de la artillería y la infantería.
La Independencia no llegó a Santiago como una noticia inesperada. La Reforma de 1843, la persecución de Charles Hérard y las misiones de Mella y Juan Evangelista Jiménez habían preparado una extensa red separatista en el Cibao.
En una circular anterior del mes de octubre próximo pasado, esta superioridad hizo a Ud. algunas observaciones sobre el género de guerra que en su concepto produciría, en la presente lucha en que estamos comprometidos con las tropas españolas, los mejores resultados. La experiencia de los acontecimientos, desde entonces acá, en nuestros diferentes ejércitos de operaciones, ha probado la exactitud con que se hicieron y lo indispensable que es tener presentes aquellas indicaciones, por cuyas razones se reiteran a Ud. en la forma siguiente:
